海南医学院的前身是海南医学专科学校，由创办于1947年的私立海南大学医学院和创办于1948年的私立海强医事职业学校合并而成，1983年学校并入海南大学，改称海南大学医学部。1993年经国家教委（现国家教育部）批准成立海南医学院，属海南省人民政府主管。1996年，学院通过国家教委本科教学工作合格评价。

学院现有教职工1300多人，教师近600人，有34名国内外著名的专家学者被学院聘为客座教授。学院下设高等职业教育学院、基础医学部、人文社会科学部、信息技术部、外语部、体育部、临床医学系、预防医学系、护理学系、药学系、检验医学系、中医学系、口腔医学系以及图书馆、学报编辑部等，拥有3所附属医院和1所中医临床学院，病床总数近3000张。建有计算机校园局域网，校园主干网传输率达1000MB。校本部图书馆拥有17.5万册藏书及中国医药文献光盘数据库等一批文献资源和专题数据库，并与中国医科院图书馆合作，实现文献资源共享服务。

学院坚持“立足本科教育，积极发展研究生和留学生教育，普通教育与继续教育并重”的办学方针，以多种模式扩展办学规模。普通高等教育开设专业有临床医学、检验医学、预防医学、药学、护理学、中医学、口腔医学、医学影像学、康复治疗学和中西医临床医学等10个本科专业及临床医学、医学检验、全科医学、口腔医学、药学、护理学和美容医学等7个专科专业；成人教育开设专业有临床医学、检验医学、护理学等3个本科专业及临床医学、医学检验、药学、护理学和口腔医学等5个专科专业。开课总门数达189门，其中必修课140门、选修课49门。与山西医科大学、安徽医科大学分别合作开办医学、卫生管理两个专业研究生课程进修班。目前已经获教育部批准与北京大学联合培养生化与分子生物学专业硕士研究生。学院从2002年起面向国内17个省招生，近五年的招生人数超过1998年前的五十年，现有各类本专科在校生近6000多人。“十五”末在校生人数将达8000人。

学院坚持“改重基础研究为主为重应用研究为主，改抓小课题为主为抓大课题为主，改分散单一研究为主为集体攻关为主”的科研工作方针，充分发挥本校的人才优势和海南省的自然优势，将分子生物学与南药开发作为科研的主攻方向，开展科技攻关，促进高新技术在海南省农牧业、医药领域中的应用，形成了分子生物学、生殖医学中心等一批特色学科。全院现有校级重点学科3个、省卫生厅重点实验室5个和优势专科18个、省级重点项目14个。承担国家863课题2项（分别任组长、副组长单位）、与企业横向联合申报国家计委课题1项，共获资助资金500多万元。近四年多来，获得院外各类资助的课题共93项，资助金额390.6万元，其中国家自然科学基金资助12项，资助金额达153.5万元；获省部级科研成果奖23项，其中省科技进步奖二等奖3项，三等奖8项，四等奖11项；发表学术论文1217篇；出版各类学科著作12部。至今，全校获批准立项国家自然基金资助项目23项，省（部）级资助项目96项，国家“863”计划资助项目2项，取得科研成果66项，其中“精子载体法转基因杂交水牛的研究”成果部分达到国际先进水平，先后发现并成功克隆出2个人类新基因，经审核已获准加入国际基因库，编号分别为GenbankAF157027和GenbankAF160979。

学院大胆走后勤社会化改革之路，实现校园基本建设跨越式发展。在建设资金未能按计划到位的情况下，将新校址划分为教学运动区、学生生活区、职工生活区三大块，分别依靠政府拨款、职工集资、驻地农村和企业出资建设，大大加快了新址的建设进程，并于2000年7月实现从原址海口市龙华路迁至新址学院路，办学条件明显改善，顺应了国家关于高等教育要超前发展的要求。如今，学院占地总面积55.3公顷，建筑面积31万M2，固定资产1.1亿元，其中教学仪器设备3500万元。学院社会效益和经济效益逐年提高。

海南医学院附属医院是学院唯一直属的附属医院，位于海口市龙华路，建于1973年，是一所集医疗、教学、科研、预防、保健、社区卫生服务于一体的三级甲等医院，也是海南省首家爱婴医院、中国医学基金会国际医学中国互联网海南唯一的远程会诊保健中心、卫生部国际紧急救援中心网络医院。医院编制床位513张，设有临床科室26个，医技科室17个，拥有日本螺旋CT仪等一批现代化医疗仪器设备，总价值8000多万元。医疗服务范围辐射到全国20多个省市及港、澳、台、新加坡、马来西亚、泰国、印度尼西亚等10个地区和国家，年门诊量达40万人次，年住院病人逾万人，医院业务收入年年迈上新台阶，2004年达1.16亿元。医院在省内率先开展了人类辅助生殖技术，现已跻身国内一流水平，被卫生部批准为海南省内唯一获准开展人类辅助生殖技术的医疗机构，成为全国首批8家获准开展人类辅助生殖技术的单位之一。此外，医院在腔镜手术、准分子激光治疗近视眼、脑立体定向手术、人工颈椎置换术、地中海贫血基因诊断、超高倍多媒体显微疾病诊断及免疫组化标记病理诊断等方面处于国内先进水平。

海南医学院在改革与发展的进程中所创造的辉煌业绩，正如一颗璀璨的新星闪耀在中国南海之滨。随着我国高等医学教育改革的不断深化和海南省创建“健康岛”力度的加大，海南医学院将再次迎来改革与发展的大好机遇期。学院将以主权制度改革带动领导体制和管理机制创新，在学院现行产权制度下，实行党委决策、院长执行、全校监督三权分离互动的管理机制，确立以辐式领导、塔型管理、网状监督为基本内涵的党委领导下的院长负责制，坚持教学、科研、医疗和相关产业四个轮子一起转，在继续完成新教学大楼、图书馆、体育馆等项目兴建和改建的同时，努力创建中国独具特色的热带医学医疗教育中心，把海南医学院建设成为学科齐全、师资雄厚、建筑新颖、环境优美、经济宽裕，办学水平高的高等医药院校。